De manier waarop de shuttles verplaatst worden van kanaal naar kanaal is van groot belang.
Oplossen van storingen aan de shuttles in de kanalen is vaak lastig omdat de shuttles slecht bereikbaar zijn.
Multi-diepe opslag kan tevens worden uitgevoerd met shuttle stellingen. Pallets staan in opslagkanalen met geleidingsprofielen op ieder niveau. Door deze profielen rijdt een shuttle. Deze shuttle verplaatst de pallets van het begin van de stelling naar de achterste, vrije locatie. De shuttles worden met heftrucks of reachtrucks verplaatst van kanaal naar kanaal. De shuttles worden gevoed door een accu.